叉指电极传感器主要包括四个结构参数，分别为：叉指电极对的对数、叉指宽度、相邻叉指之间的间隙距离以及叉指电极的厚度。这四个参数对基于叉指电极的生化传感器关键性能指标都有很大影响。通过分析叉指电极阻值的计算公式可发现，叉指的长宽比越大，叉指的密度越大，叉指电极的初始电阻越小，从而传感器的灵敏度和响应速度就会越高。当叉指电极结构尺寸减小到微米量级以下，叉指电极结构间的微弱的电阻变化可以被灵敏地检测到，叉指电极传感器的灵敏度得以显著提高。叉指电极结构周围的电场分布可以通过理论分析以及数值模拟计算得到，计算结果表明叉指电极传感器的电场强度与电极厚度成近似反比关系，电极越厚，电场强度越小。因此，通过优化叉指电极传感器的相关结构参数可以提高生物化学传感器的性能，当应用于不同的传感检测领域时，可能需要使用不同结构参数的叉指电极结构。
分析表明，叉指电极传感器的电极对数对叉指电极传感器的信噪比没有影响。原因在于：叉指电极传感器的信号的大小和噪声的大小都和叉指电极结构的表面积成正比例变化关系。当叉指电极对数增加时，叉指电极结构的表面积随之增大，叉指电极传感器的信号的大小和噪声的大小同时等比例增大，使得叉指电极传感器的信噪比基本保持不变。因此可以得出结论，电极的对数对叉指电极传感器信噪比的大小基本没有影响。叉指电极间距的减小可以使信噪比增大的同时提高信号幅。如应用于化学传感领域，叉指电极间距的减小还可以有效地提高化学反应的速率、加快建立反应进行过程，从而能够提高传感器性能，并缩短叉指电极传感器反应的时间。叉指电极传感器的电极宽度的减小在提高信噪比的同时会使检测信号的幅值降低。
